Mechanisms controlling gene expression in hypoxia and inflammation

这个自筹资金的博士项目旨在研究细胞如何应对低氧（缺氧）和炎症这两种通过共同生物学机制相互关联的生理状态。氧气对生命至关重要，当其水平下降时，细胞会激活一个由HIF-1α和HIF-2α蛋白调控的系统，以帮助自身适应环境变化。这些HIF蛋白受到一系列氧感应酶的调控，其中包括脯氨酰羟化酶以及参与DNA、RNA和组蛋白修饰的其他酶类——这些分子均在基因表达调控中发挥重要作用。值得注意的是，HIF蛋白反过来也会影响这些酶的活性，从而形成一个反馈回路，从多个层面调控基因表达。 Rocha实验室以往的研究表明，HIF系统不仅响应氧气浓度的变化，还在炎症过程中发挥作用，并与一种关键的免疫相关蛋白NF-κB发生相互作用。这种缺氧与炎症之间的联系在进化上具有保守性，甚至在果蝇（黑腹果蝇）中也能观察到。本项目将运用蛋白质组学、基因组学、成像技术和分子生物学等多种方法，揭示这些信号通路之间的相互作用机制。研究目标是深入理解细胞在代谢与免疫反应之间的协调机制，为涉及缺氧和慢性炎症的相关疾病提供新的认知和治疗思路。