Exposing dynamics in bacterial responses to antibiotic treatments using metabolomics and network analysis

该博士项目将在利物浦大学代谢组学研究中心开展，利用网络分析研究细菌在接触抗生素时其代谢随时间发生的变化。通过分析使用气相色谱-质谱（GC-MS）和液相色谱-质谱（LC-MS）采集的纵向代谢组学数据，项目将构建时间分辨的代谢网络，以追踪在抗生素胁迫下代谢物和代谢通路的动态变化。这些网络中的节点代表代谢物，边则表示生化关系或相关性。网络结构随时间的变化将有助于识别关键代谢物、通路适应机制以及与抗生素耐药性或敏感性相关的潜在生物标志物。该项目旨在揭示细菌隐藏的生存策略，并推动更有效的抗菌疗法的开发。学生将接受专家指导：Roy Goodacre 和 Howbeer Muhamadali 将指导实验设计和质谱技术，Yun Xu 将指导高级数据分析和网络建模。团队此前的相关工作包括对产酸克雷伯菌（*Klebsiella oxytoca*）对环丙沙星反应的研究，以及利用傅里叶变换红外光谱（FT-IR）鉴定引起败血症的病原体。所有研究成果均可免费在线获取。